Dinas Pertanian, Ketahanan Pangan dan Perikanan Kabupaten Ponorogo terdiri dari 6 Bidang dan Sekretariat, yaitu:
- Sekretariat
- Sub Bagian Umum dan Kepegawaian
- Sub Bagian Keuangan
- Sub Bagian Penyusunan Program dan Pelaporan
- Bidang Ketahanan Pangan
- Seksi Ketersediaan dan Kerawanan Pangan
- Seksi Distribusi dan Cadangaan Pangan
- Seksi Penganekaragaman Konsumsi dan Keamanan Pangan
- Bidang Prasarana dan Sarana Pertanian
- Seksi Pengelolaan Lahan dan Irigasi Pertanian
- Seksi Pengelolaan Pupuk Pestisida dan Pembiayaan Pertanian
- Seksi Pengelolaan Alat, Mesin, dan Investasi Pertanian
- Bidang Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Seksi Perbenihan dan Perlindungan Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Seksi Produksi Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Seksi Pengolahan dan Pemasaran Hasil Tanaman Pangan dan Hortikultura
- Bidang Perkebunan
- Seksi Perbenihan dan Perlindungan Perkebunan
- Seksi Produksi Perkebunan
- Seksi Pengolahan dan Pemasaran Hasil Perkebunan
- Bidang Peternakan, Kesehatan Hewan dan Perikanan
- Seksi Usaha dan Produksi Peternakan
- Seksi Usaha dan Produksi Perikanan
- Seksi Kesehatan Hewan dan Kesehatan Masyarakat Veteriner
- Bidang Penyuluhan
- Seksi Kelembagaan Penyuluhan
- Seksi Ketenagaan Penyuluhan
- Seksi Metode dan Informasi Penyuluhan